Этими нормативными правовыми документами упразднен ведомственный санитарно-эпидемиологический надзор и создана единая Государственная санитарно-эпидемиологическая служба, в которой объединены санитарно-эпидемиологические органы и учреждения Министерства здравоохранения Российской Федерации и всех силовых ведомств, в том числе Министерства обороны. По новому Положению деятельность военно-медицинской службы в этой области именуется государственным санитарно-эпидемиологическим надзором, а специалисты государственными санитарными врачами. Санитарно-эпидемиологические учреждения военных округов, флотов, гарнизонов называются центрами государственного санитарно-эпидемиологического надзора на соответствующей территории (в зоне). Они обязаны приобрести статус юридических лиц, пройти аккредитацию и лицензирование, чтобы получить право на проведение экспертиз и выдачу санитарно-эпидемиологических заключений, которые, как и заключения государственных учреждений, будут действительны и обязательны для юридических и физических лиц на всей территории страны.